הספינות הועברו לידי הנציגים הטורקים בעקבות החלטת הדרג המדיני ובהמשך לבקשת השלטונות התורכיים, לאחר שהספינות ניסו להפר את הסגר הימי על שלטון חמאס ברצועת עזה.
במקביל שלח משרד החוץ איגרת לשלטונות תורכיה שבה הובעה ציפייתה של ישראל מתורכיה למנוע מספינות תורכיות להפר את הסגר הימי על רצועת עזה. באיגרת הודגש שישראל מעבירה ציוד וסחורות לעזה באופן שוטף דרך המעברים היבשתיים, באופן שמקובל על הקהילה הבינ"ל ומעוגן בהסכמים מוכרים.